mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTTGTCCCGGTCTA GACCAGACAAAGTGTATTGCG ATCATAACCACAACTATGTATCAATATGCCTAGACCAGACAAAGTGTATTGCGTTGTTGCAATCGTATTGCACTTGTCCCGGTCTAAGCATTTGGTAAGAAAG 2 2 3' arm Ciona_savignyi mirbase ciona-mir-92 2e-39 cin-mir-92a 0.0003 -34 ..................((((((.((((.((((((.(((((.(((((.(((((((...))).)))).))))))))))..)))))).))))))))))...... (-34.00)