mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCAA CGTGTTTATTGTGGACCTTGCC TTATAATCGACGTCATAGCCAAGTTCGATCGTGTTTATTGTGGACCTTGCCGTGTGACGTCACAGTAAGGCACGCGGTGAATGCCAACGAACTCGCGCTGCAT 5 0 3' arm Ciona_savignyi mirbase mir-124 3e-38 cin-mir-124-1 4e-22 -37.8 ...............(((((.((((((...((((((((((((..((((((.(((......))).))))))..))))))))))))...)))))).).))))... (-37.80)