mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTACCGTGAGTAATAAAGC CTTGTTACCTACGGTACCAGG GTGTCATAATTATGGTTTTCGATGCTGCCTTGTTACCTACGGTACCAGGTAGAAAGTAAGTCATCTCGTACCGTGAGTAATAAAGCATTCTCGGAGGCTCA 3 0 3' arm Ciona_savignyi mirbase 100 cin-mir-126 2e-36 -34.3 .............(((((((((.(.(((.(((((((.((((((((.((((.((.......)))))).)))))))).))))))).))).).))))))))).. (-34.30)