mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCATAGTAATAAAAGTGATC CATTTTAATACTATGCAGCT GGAAAACATTGTCTTTACTGTTCACGAGTGTCATTTTAATACTATGCAGCTTTGAATAATGTTAGTTGCATAGTAATAAAAGTGATCATGCGTTTACAAGAA 3 1 3' arm Ciona_savignyi mirbase mir-153 3e-41 cin-mir-153 0.000000005 -27.7 ..................(((..(((.((((((((((..((((((((((((............))))))))))))...))))))).))).)))..))).... (-27.70)