mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCACTAGTAGAAATCACTG GTGGTTTCACAGGTGCCATAAA ACAGTGTTGACGAAATATGGCACTAGTAGAAATCACTGTAGCCAACACCCAGTGGTTTCACAGGTGCCATAAATTGGAAACACTACTTTCTACAGCGATAACA 1 1 5' arm Ciona_savignyi mirbase mir-183 9e-48 100 -37.8 ..((((((..(((..(((((((((.((.((((((((((...........)))))))))))).)))))))))..)))..))))))................... (-37.80)