mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATCTCAGCTGGCAATCTGTGA ACAGATGCAGATGGGATTCTG TGTCCCGGCTCATTCTAATCTCAGCTGGCAATCTGTGATTGGCTGAAAATCACAGATGCAGATGGGATTCTGATGAGTCGGGA 2 2 5' arm Ciona_savignyi mirbase mir-216 6e-36 cin-mir-216 0.000001 -44.9 ..((((((((((((..(((((((.(((.((.(((((((((.......)))))))))))))).)))))))..)))))))))))) (-44.90)