mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTGCATTAGGAACTGATTGG ACTCAGTTTCAGGTGCATTAAA GAAAGTGGGGCGAGATACTGCATTAGGAACTGATTGGTTGTTAATTTCACTCAGTTTCAGGTGCATTAAATTGCTACACTATATGTCATCCACCAGTATGAG 4 0 5' arm Ciona_savignyi mirbase mir-217 5e-40 cin-mir-217 0.000005 -31.5 ...((((..((((..((.(((((..((((((((.(((.........))).))))))))..))))).))..))))..)))).....((((.(....).)))). (-31.50)