mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAAGAATTGCAGGTGGTAGGT AACCTCTTGTAAATCTCCAACA ACCATCAGGCTGGTATAAGCGTAACCTCTTGTAAATCTCCAACACTAAGCTTGGTTACAGCTCTGTTGAAGAATTGCAGGTGGTAGGTGCTATCCATGCATTA 6 0 3' arm Ciona_savignyi mirbase mir-1497 1e-34 cin-mir-1497 0.000000005 -31.8 ........(((((.(((.(((..(((.(((((((.(((.(((((...((((.(....))))).))))).))).))))))).)))...))))))))).)).... (-31.80)