mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC TAGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTGGTATATATGAATATATGATGTCTTTACCTCTGATCTCTCCCTGACTGTCACGGATCCATGAATCCAGGATGAGGGGAGGGAAGAAAGAGGGATAATGAGCATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGAGCACATC CCCGGCCTCTCTTCTCTCTCTATCTCTATCCCCCGGCCCTGTCTCGGATAGATGAGTAGTCTAGCTTGTTCCTGCTGCTCTTCTTTCTCCATTAGAGAGGGTAGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTGGTATATATGAATATATGATGTCTTTACCTCTGATCTCTCCCTGACTGTCACGGATCCATGAATCCAGGATGAGGGGAGGGAAGAAAGAGGGATAATGAGCATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGAGCACATCGAAAACCCTAGCTAGCTAGCTGTATTTAATTTCCATCCATGCGCTGAATCATCGATGGGTGTTGTCAGGTCAGTTCTTGTAGAATTCATTCATGCTGTACTTGGATCGGATCAGATATATATGGTGAGATCCAAATCAGATATATAGATCAGATTAGCTCAAGTTTAATTCCGCTGTTGATGTTGATTTGTGATAATCTTCTTGTAATTTCTTCTTTTGTGCTTGTGCGCGCTCTCTCTCTTCGGTTCAGTTATGCAGAGGTCGAATATATATGTAATTTTTGGGGTTTCTTTCCACTTATGATTCCTTCTTCAACTCTCTCTCTCTCTAGATCTCTTCCTCTAACTCTAGATCTCTCTCAAGTGGTT 0 1 5' arm Saccharum_officinarum mirnest MIR167_1 2e-32 sof-MIR167b 3e-104 -76.2 .....((((.((((.(((.(((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)).((....(((((..(((((((((...((((..((((......))))..)))).)))))))))....)))))......)).))))))))))))))))))))))))).))).))))..))))... (-76.2)