mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT CTATGCAGCCAACTGCCTTTCC TGTGGGCTCCTGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTAAGGGGCAGACATTCATCTTCCCTTATCGGAGATAAGCTATGCAGCCAACTGCCTTTCCCAGGGCTTCGC 2 0 5' arm Petromyzon_marinus mirbase let-7 0.0000004 pma-let-7a-2 0.00000002 -55.6 .((((((.((((((..((((((((.(((((((((((((((((((.(((......))).)))))........)))))))))))))).)))))))).)))))))).)))) (-55.60)