mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AACAAGTCACAGTCTCCCGTC CTGGTCTGCTGCCAGGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTGAAATATGAAAATGAGCAACAAGTCACAGTCTCCCGTCTAGCACAGACTTC 2 2 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-7 0.0000003 pma-mir-7a-1 0.00000007 -38.3 ..((((((.(((.((..((.(((((.(((((((.((((((....(((....))))))))))))))))))))).))..)).))))))))).. (-38.30)