mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTTGTGATTGTGTTGT AACAAATCACAGTGTTCCGCA GGCGGAGCTGTGGGCCATGTGGAAGACTTGTGATTGTGTTGTTGTATCGCTAAAGCAGGCAACAAATCACAGTGTTCCGCATGGAGCGGTGCTCCTT 1 2 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-7 0.00002 dre-mir-7b 0.000001 -46.9 ...(((((..((..((((((((((.(((.((((((.(((((((.....((....)).)))))))))))))))).))))))))))..))..))))).. (-46.90)