mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTTGGTTAAGTAGCTTTATG TACAGCTAGATAACCAAAGACA GGAACGGATCCCTGCTTTTGGTTAAGTAGCTTTATGGCGGGATTCTGACACTCATACAGCTAGATAACCAAAGACAGGGGCCGTCCCT 5 0 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-9 0.00000008 pma-mir-9a-1 7e-45 -39.7 ((.((((.((((((..((((((((..(((((.(((((..(........)..))))).)))))..))))))))..)))))))))).)). (-39.70)