mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGTGCATCTAGTGCAGATAG ACTGCTCTATGTGCTCCTTTAC CCTGTGCTTGCTTGTGCTAAGGTGCATCTAGTGCAGATAGTTCCGCTGCGTAAATGCTACTGCTCTATGTGCTCCTTTACCCACAAGAGGTCACGCT 4 1 5' arm Petromyzon_marinus mirbase 100 dre-mir-18a 0.0000000003 -34.64 ...((((((.((((((..((((.((((.(((.((((.((((..............)))))))).))).)))).))))....))))))))).)))... (-34.64)