mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAGTGCTTATAGTGCAGGTAG ACTGCATTTTGAGCACTTGTAG CTGCCCACAGGGTGCCAAAGTGCTTATAGTGCAGGTAGTTGATCTTAGTCTACTGCATTTTGAGCACTTGTAGCACCAGGTGTGGAAAAAC 3 1 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-17 0.000001 xtr-mir-20a 0.000000004 -40.3 ...(((((..(((((..(((((((((.(((((((.((((((....))).)))))))))).)))))))))...)))))..))).))...... (-40.30)