mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCACATTGCCAGGGATTACCGC GGGGTTCCTGGCACGGTGATTT TGCTGAGTGGGGTTCCTGGCACGGTGATTTGTAATGTGCAGAGACAAAAATCACATTGCCAGGGATTACCGCTCAGTG 2 1 3' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-23 0.000001 pma-mir-23b 0.0000002 -41.4 .((((((((((((((((((((..(((((((....(((......))).)))))))..))))))))))).))))))))). (-41.40)