mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATTGTAGTTGCATTGTAT ACAATGCATCTGCAGTGCAGCA TCAACTGTGGCTGTGGTGCATTGTAGTTGCATTGTATGGGAAGGGATGTACAATGCATCTGCAGTGCAGCACAGATACAGTGAA 2 0 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-33 0.000004 xtr-mir-33a 0.000001 -46.9 (((.(((((.(((((.((((((((((.(((((((((((........))))))))))).)))))))))).))))).)))))))). (-46.90)