mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCAGCATCGTACAGGGCTTGGA CAGCCTCTCTATGGTGCTGCCTTG CCGCTCCTTTCAGCCTCTCTATGGTGCTGCCTTGTGTCAAACCTGCGTGTCAAGCAGCATCGTACAGGGCTTGGAAAGTGTCG 1 3 3' arm Petromyzon_marinus mirbase 100 xtr-mir-103-2 0.0002 -30.7 .((((..((((((((.((.(((((((((((.(((...((........)).)))))))))))))).))))).)))))))))... (-30.70)