mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTGCAATGTTGAAAAAGGGCAT GCCCTTTCAACGTCGCACCGCT GGACGACCCGATGCCCTTTCAACGTCGCACCGCTGTGAGCAGAGCGAGCAGTGCAATGTTGAAAAAGGGCATCGGTTCGGTT 2 2 3' arm Petromyzon_marinus mirbase 100 rno-mir-130a 0.0002 -43.8 ...(((.((((((((((((((((((.((((.(((((.......)).))).)))).)))))))..))))))))))).)))... (-43.80)