mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTTG AGCTGGTAAAATGGAACCAGAT TGCTTTGCTGGAGCTGGTAAAATGGAACCAGATCAACTAACCAACGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTTGAGCTACG 5 0 3' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-133 0.000000000000001 mml-mir-133c 3e-19 -31 ......(((.((((((((..((.((.((((((((............)))))))).)).))..)))))))).))).... (-31.00)