mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTC GCTGGTAAAATGGAACCAAATC TGGAATGCCTTGCTGGCGCTGGTAAAATGGAACCAAATCAACATTTCAACGGCTTTGGTCCCCTTCAACCAGCTCTAGATAAGCATTATG 5 0 3' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-133 0.0000000000003 gga-mir-133a-2 8e-17 -28.4 ...(((((.(((((((.((((((..((.((.((((((((...........)).)))))).)).))..)))))).)))).))))))))... (-28.40)