mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTTATTCCTATGTGA GCGTAGGGGTGAAAGCCATGGA TTGTATCTGTGCTTTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATTGCTTCTGTAACCTCGCGTAGGGGTGAAAGCCATGGAACACGGTGCAA 0 1 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-135 0.00000000002 tgu-mir-135a-2 0.000000000004 -42.5 .((((.(((((.((((((((((((.((((((((((((((((....))))..)))))))))))))))))))))))).))))))))). (-42.50)