mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTATTGCTTAAGAATACACGTAG ACGCGTATTCTTGGGTAAATAATA ATAGCTCCTCGCGGCGACGCGTATTCTTGGGTAAATAATACGTTTCCCGCTGTTATTGCTTAAGAATACACGTAGCCGGGGGGAGTGCG 2 1 3' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-137 0.000000005 pma-mir-137-2 0.000000000004 -46.1 ...(((((((.((((.(((.((((((((((((((.(((((((.....)).))))))))))))))))))).))).)))).)))))))... (-46.10)