mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTGGTTTTACCCTATGGTAG ACCACATGGTAGAATCACGGCC TCGACCGCTCAGTGGTTTTACCCTATGGTAGCTTTGAATGGCAGACTCTACCACATGGTAGAATCACGGCCCGGTGAC 5 0 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-140 0.00006 dre-mir-140 0.000004 -29.2 ((.((((....(((((((((((...((((((.((((.....))))..))))))...)))))))))))....)))))). (-29.20)