mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGACGGAGGACTGATAAGTGT CCTTATCACTCTTCTGCTCCAGC TCGCCGCCCTCCCTTATCACTCTTCTGCTCCAGCCCTGAGGTTTTAATTCCGCTGGACGGAGGACTGATAAGTGTGGGCGGGGT 3 1 3' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-184 0.0003 spu-mir-184 0.001 -44.1 .(.((((((.(.(((((((.(((((((.((((((...(((.......))).))))))))))))).))))))).).)))))).). (-44.10)