mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATATGTTTGGTATAAGGTTG ATCAACTGTATATCAAACATATGGTC CTTGCAAGCCACTGTCTGATATGTTTGGTATAAGGTTGTTTCAGTAACAATCAACTGTATATCAAACATATGGTCACAGTAGCTTGCTCA 2 4 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-190 0.0003 pma-mir-190a 0.00007 -36.5 ...((((((.(((((.(.((((((((((((((.(((((((.....))))))).....)))))))))))))).)..))))).))))))... (-36.50)