mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGTAGTATCATGTTGTTGGG CGACAACGCGTCACTGCCTTCA TCACGTGGTGTAGGTAGTATCATGTTGTTGGGTATTTACAACATCCTCGACAACGCGTCACTGCCTTCACCACGCCA 4 0 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-196 0.001 pma-mir-196a 0.00005 -34.42 ...(((((((.(((((((..(.((((((((((.............)))))))))).)..))))))).)))))))... (-34.42)