mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCAGTGTTCAGACTACCTGTTC ACAGTAGTCTGCACATTGGTTA GTTCCGTCTCCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCAGGAGGTTAATGTTGTACAGTAGTCTGCACATTGGTTAGACTGAGC 3 1 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-199 5e-21 xtr-mir-199a 3e-22 -36.5 ((((.((((..(((((((.((((((((.(((.(((.(......).))).))))))))))).)))))))..)))).)))) (-36.50)