mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAAATGTTTAGGACCACTTG AGTGGTTCTAACCAGTTCAACAG CATGGTTACCGAGTGCAGTGGTTCTAACCAGTTCAACAGTTCTCTACTGAAATTGTGAAATGTTTAGGACCACTTGACTCGGTAGCTCCA 4 1 3' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-203 2e-23 xtr-mir-203 3e-19 -41.2 ...(((((((((((..(((((((((((.((.((((.(((((.((....))))))))))).)).)))))))))))..)))))))))))... (-41.20)