mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTGCTTGATCTAACCATGTG CATGGTTCCTTCAAGCACCAGG CGTCGCTTTCCCTTGTGCTTGATCTAACCATGTGCTTGCCGCGCTCAAGACAAAACAAAACATGGTTCCTTCAAGCACCAGGGAAGGCCACG 5 0 5' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-218 0.0000003 mmu-mir-218-1 0.00000002 -42.5 (((.(((((((((.((((((((...((((((((.((((.......))))..........))))))))...)))))))).))))))))).))) (-42.50)