mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTACATTGTCTGCTGGGTTC ACCTGGCACACAGTGTAGGAGACTGT CGAGGCCTGGACCTGGCACACAGTGTAGGAGACTGTGTAACCATGGCAACAGCTACATTGTCTGCTGGGTTCAGGTTGCC 3 4 3' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-221 0.0000003 cfa-mir-221 0.00000002 -40 .(..(((((((((..(((.(((((((((....((((((.......)).))))))))))))).)))..)))))))))..). (-40.00)