mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTGCAATTGTATTGTCAAAGCT CTCTGACACCATTGCACTACTGTACGCAATGGTGAGCAGTGCAATTGTATTGTC AACTTGCAAGCCCCTGCTGGAGGCTCTGACACCATTGCACTACTGTACGCAATGGTGAGCAGTGCAATTGTATTGTCAAAGCTTCCGTCGGTGAGCCCA 5 30 5' arm Petromyzon_marinus mirbase 100 mmu-mir-301a 0.000005 -37.6 .........((.((((.((((((((.((.(((((((((((....))..))))))))).(((((((....))))))))).)))))))).))).).))... (-37.60)