mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAGTGCTTGATTTGTTGTGA ACAGCAATTTCGAGCACTCTGCT TCTGTTCACGTTTACAGCAATTTCGAGCACTCTGCTAATTTATAATAGCAAGTGCTTGATTTGTTGTGAACGAGAATCAC 1 2 3' arm Petromyzon_marinus mirbase 100 pma-mir-430d 7e-23 -37.3 ...((((.((((((((((((..(((((((((.(((((........)))))))))))))).)))))))))))).))))... (-37.30)