mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAGTGCTTGATTTTGTTGTGA ACAGCATTTCGAGCACTCTGCT CATTCTGTTCACGTTTACAGCATTTCGAGCACTCTGCTTAATTTATAATAGCAAGTGCTTGATTTTGTTGTGAACGAAAACAGACGC 2 2 3' arm Petromyzon_marinus mirbase 100 pma-mir-373 2e-26 -39.1 ...((((((..(((((((((((..(((((((((.((((...........)))))))))))))...)))))))))))..))))))... (-39.10)