mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGGCTGGTTAGATGGTTGTCA CAGGCATCTTTCCAGCCTACACGTG GTTATGCCCGTGTGCAGGCATCTTTCCAGCCTACACGTGGGGTCCTGATTCTGCAGGCTGGTTAGATGGTTGTCACATGCATGAC 3 5 3' arm Petromyzon_marinus mirbase mir-456 0.000000000005 dre-mir-456 0.0000000000003 -41.9 (((((((..((((((((.(((((..(((((((....(..((((....))))..))))))))..))))).))).)))))))))))) (-41.90)