mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTGTGCAGTATATTACATTT ATGGAATATATGTACACACAGG GACCTGTGCGTGTATATGGAATATATGTACACACAGGATATTACATAATCTACGTGTGTGTGCAGTATATTACATTTATGAGCTACAGTAC 2 1 3' arm Petromyzon_marinus mirbase 100 pma-mir-4571 1e-46 -28.8 ...((((((..(((.(((.((((((((((((((((((((........))))...)))))))))).)))))).))).)))..)).))))... (-28.80)