mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGGACCGGTCCGGATTTCC GAGTCTGGTCGTTGTAGCC CGGCTGGACCGGTCCGGATTTCCCGGGATATCGTCGACCCACGCGTCCGGTTTGAGTTTCCCCAAGAGTCTGGTCGTTGTAGCC CGGCTGGACCGGTCCGGATTTCCCGGGATATCGTCGACCCACGCGTCCGGTTTGAGTTTCCCCAAGAGTCTGGTCGTTGTAGCCGGTTTGGACTTGATTCAAGATTGGCAGCTGAAGTACGCGGAAGGGCTGAAGAGAGCAGGTCAAGAGGTGAAGCTTCTTTACTTGGATCAAGCCACCATTGGGTTCTACTTGTTGCCTAATAACAATCACTTCCATACCGTTATGGAGGAGATAGCTGCGTTTGTTAACGCAGAATGCCAATGAAAACGCCGTTATCTCTCACTAACAAACGGGTGAAGTCCACCGTGGAAGGTGAAGGAAGGCCCGAGATTCTCGTTTTAGAAGCTCCCTTGTATGGCGTTTAACTACTACCACGGAGGTTGTGGTGGCGTCTGAGTTTGTGAACCGTGCGAAGCTGGATTCTGAGAGCAAAGCAGGAAGAATAACAGTGAAGGCGGTAATGTGTTTGGCTTTTAGCGTTAGCGTTTTAACTAAAACTACAGCTATGTTTTTTCAGCTTGCGGTTGATAGTAACTCTGGTTATGTTACTATTATGATATTTTCAGTATATATATATATGCGTAATGAACAATATATGTTTATTATAGGTTGTTGTAACTTGAGCAGTGTGGTGTTGTGTTTGCTTAATCTGCAACTGAGATATTTTCTTAATGTAATGAATAAGAAAGCATTCACTTGAAGAAATAAATGTATATATAGTT 5 1 5' arm Brassica_napus mirnest 100 100 -24.8 .(((((...(((.((((((((...((((..(((..((((.........)))))))...))))...)))))))))))...))))) (-24.8)