mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGGCTTAATAGATTCGTCT ACAAATCTATTAAGTCTAATA TGATACCAATTAGGAGTATTAAATATGGGCTAATTACAAAACTAATTACACAGGTTGAGGCTAATTTGCGAGACAAATCTATTAAGTCTAATAACTCCATGATTTGCGAGACGAATCTATTAAGTCTAGTAAGTCCATGATTTTGGCAATGTTGTGCTACAATAAACATTTGCTAGTTAGAAATTAATTAGGCTTAATAGATTCGTCTCGCTAATTAGTCTACCCATGTGCAATTAGTTTTATAATTAGCTCATATTTATTCTTTCCAATGCGACGC CGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGATCGAATCTTTGATACCAATTAGGAGTATTAAATATGGGCTAATTACAAAACTAATTACACAGGTTGAGGCTAATTTGCGAGACAAATCTATTAAGTCTAATAACTCCATGATTTGCGAGACGAATCTATTAAGTCTAGTAAGTCCATGATTTTGGCAATGTTGTGCTACAATAAACATTTGCTAGTTAGAAATTAATTAGGCTTAATAGATTCGTCTCGCTAATTAGTCTACCCATGTGCAATTAGTTTTATAATTAGCTCATATTTATTCTTTCCAATGCGACGCAGCTAAATTTAACCCTGCATCCAGACACGGCCTCGCACGTGCACTCATGAGTCACGACTCATCTCTCGGGTTATCTAGGCGTCCGTATCCTTGTGCTTGCCTGTTGTTGGACTGCCCACTCTGTTACGGAAGCAGTACGTGTAGCGTCAGCAATTGTTTTCTTGCCGGAGAATGATGTCTGATTCTTTTTCTGCGAGAAAATCTAACTTCGTTTCTCTCCCTACGATCCCAGCAGGCTACGGCGCATGCGTGTACACCGGGGGAGGGCCAATATGCACCACACGGTGCTAACCCCGGGCACATGATTATTTTTGGAGTCCATGCATGATGGATTGCGAGTGAAAGGTTGGG 1 0 3' arm Saccharum_officinarum mirnest 100 osa-MIR2124e 0.000000000000001 -94.7 ............((((...(((((((((((((((((.((((((((((.((((((...(((((((((.(((((((.((((((((((((((((((((..((((((((((.((((...........)))).)))))).))))....((((((...(((..........))).))))))))))........)))))))))))))))).))))))).)))))))))..)).)))).)))))))))).)))))))))))))))))....)))).......... (-94.7)