mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCGCCCGCCACAATCCCG GAGATTGTCCAGTGGTGGCTAAG TAAGCTGAGCCAGCCGCCCGCCACAATCCCGGTCAAGTCCTATTGACCGGAGATTGTCCAGTGGTGGCTAAGAGCAGTGAC 4 2 5' arm Petromyzon_marinus mirbase 100 pma-mir-4599b 0.000004 -39.8 ...((((..(.((((((((...((((((((((((((......)))))))).))))))...).)))))))..)..))))... (-39.80)