mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTAAAATGGAACCAAAT CAGTGCTTTGCTAAAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCACCTCTTCAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGGATTGCATTG 5 0 3' arm Xenopus_laevis mirbase mir-133 2e-27 xtr-mir-133a 6e-42 -34.7 ((((((..(.(((.(((((((..((.((.((((((((............)))))))).)).))..))))))).))).)..)))))) (-34.70)