mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCAGTTTGTCAAATACCCC TGTATTTGACAAGCTGAGTCCGACACT TGTGTGGCACTGAGTGTATTTGACAAGCTGAGTCCGACACTCAGTGAGACAGAGTGTCAGTTTGTCAAATACCCCAAGTGAGGCAC 2 6 3' arm Xenopus_laevis mirbase mir-223 3e-32 xtr-mir-223 1e-40 -36.7 .((((..((((..(.((((((((((((((......(((((((.(.....).))))))))))))))))))))).)..))))..)))) (-36.70)