mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTGGGACGGAGGGAGTACA TACTCCCTCTGCCCCAAAATA TTGTTCCTGTACTCCCTCTGCCCCAAAATAAATGTACATATCTCATTTATCGAAGAGTAACTTTTTAAGCTTGACCAAATATACACACAAAAGTACTGATGTTTACGATGTGTAATAAGCATCATTACATTTATCATGGAATACCCTTTTATAGTAAACTTATTTCAAGATACAAATATTGATACAATTCTCTATATAGCTAGTCAAACTTAAAAAAAAGTTTGACCTCGAAAAGCGAGATATGCATTTATTTTGGGACGGAGGGAGTACACTACAA AAGCCTGTAGTGATGGAATTTATTCGGAGCTTGTTCCTGTACTCCCTCTGCCCCAAAATAAATGTACATATCTCATTTATCGAAGAGTAACTTTTTAAGCTTGACCAAATATACACACAAAAGTACTGATGTTTACGATGTGTAATAAGCATCATTACATTTATCATGGAATACCCTTTTATAGTAAACTTATTTCAAGATACAAATATTGATACAATTCTCTATATAGCTAGTCAAACTTAAAAAAAAGTTTGACCTCGAAAAGCGAGATATGCATTTATTTTGGGACGGAGGGAGTACACTACAATATAGTATGATGTCATGAAATCCGCTTTCTTGATGAATATGACAAATGCGGTAGTCTGTAGGATCTATAATCTGAATAAATTTGATACTCAAATGTAACTATAATATAAAGAATAACTGGAACCTCTATGCTTAATAAATACTGAGCTAATCACCTTTGCTGACTTAGATGTCAGAAGCTCGTGTCTACTGGAAGTCAAAGTTTTTGCGAAGTGTAACTAATTTTCTTCCAGGAGTTGATTGGGTGGTAATGTCTTGATGAGAGGTTTCACGGATTCCATGATACTAGCAAAAGAGGGTCGTCTTCAGGGTTCTCTGATCCAACAAGACTCAATTACTGCCGCCACTTTCGGATCAACACTGCTTGGGATCTCAAGGCTTCGTCCCTTGAAAACAAAAGCTGCTTACAACTGAGCTGGATTTAAATTACTCCATGGCTGGTGCAATGTCAAAATCCCCATAGGATGACACCGAACCTGTAAAATTAAGAATTCTCC 1 0 3' arm Saccharum_officinarum mirnest MIR806 0.00002 osa-MIR1862e 0.00001 -75.8 .(((...(((((((((((((.((((((((((((((..(((((((.(((.((((.....(((((((((((.(((((....((((.........(((.((((((((..(((((.......)))))........((((.(((((((.................))))))).)))).)))))))).))).........))))....))))).))))...))))))).....)))).))).))))))))))))))))))))).)))))))))))))..))). (-75.8)