mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGTGCTCTCTAGTTCGGTTG GCCTAACTGGAGCCCTGTCT CACGTCGGCCTAACTGGAGCCCTGTCTCATTGCAGCTGTGAGTAAGTGCTCTCTAGTTCGGTTGCTGAGTG 4 2 3' arm Xenopus_laevis mirbase 100 xtr-mir-428 7e-35 -23 (((..(((((.(((((((((.((..(((((.......)))))..)).)))))..)))).)))))....))) (-23.00)