mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGATTGTATAGTT CTATACAGTTTACTGTCTTTCC TGCAGGATGAGGTAGTAGATTGTATAGTTTTGGGGTCACACCCGATCTGGGAGATAACTATACAGTTTACTGTCTTTCCTGCG 3 0 5' arm Xenopus_tropicalis mirbase let-7 9e-26 mdo-let-7f-2 5e-30 -40.5 .((((((.(((..(((((((((((((((((((((......)))))..........))))))))))))))))..))))))))). (-40.50)