mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTA CATACTTCTTTATGTACCCATA ACCTGTTTGGAGTACATACTTCTTTATGTACCCATATGAACATACAATGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTTTATCAGG 1 1 3' arm Xenopus_tropicalis mirbase mir-1 4e-37 eca-mir-1 1e-33 -32.04 .((((...(((((((((((((((((((((..(((((..............))))).)))))))))))))))))))))...)))) (-32.04)