mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTA CATACTTCTTTATATGTCCATA TGGGAGACATACTTCTTTATATGTCCATATGGAAGTGCCAATGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATCTC 1 1 3' arm Xenopus_tropicalis mirbase mir-1 0.00000000000002 mml-mir-1-1 4e-18 -31.1 .((((.((((((((((((((((.(((((((((.....)))....)))))))))))))))))))))).)))) (-31.10)