mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTA GCTGGTCAAACGGAACCAAGT CTGCTATGGCTGGTCAAACGGAACCAAGTCCGTCTTCCTTAGAGGTTTGGTCCCCTTCAACCAGCTATTGCAGTA 4 0 3' arm Xenopus_tropicalis mirbase mir-133 2e-26 xla-mir-133b 3e-37 -33.6 ((((.(((((((((..((.((.((((((.((.(((.....))))))))))).)).))..))))))))).)))).. (-33.60)