mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATAAAGTAGAAAGCACTAC AGTGTTTCCTACTTTATGGA CAGTGCAGCCACCCATAAAGTAGAAAGCACTACTAGACAGGACTGAACGCTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGATGAGTGTACTGGG 1 0 5' arm Xenopus_tropicalis mirbase mir-142 6e-27 xla-mir-142 1e-43 -39.7 (((((((..((.(((((((((((.(((((((((.((...(.......).))))))))))).))))))))))).))..))))))).. (-39.70)