mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAAGTTTGACTTAGGACAAA ATTGTCCTAAGTCAAAAGTTTTC TCTCTATGTTCTGTTACGTCCTATGTTCCAAAGTGTAAAGTCTTTTTAGGTTTATTGTCCTAAGTCAAAAGTTTTCAAGTTTGACCAAATTTATAGAAAATTATTTTCAACACTAAACAAATATACTATAGAGATATTCAGTGGTGGATTTAATGAAACTAATCTAATGTTGTTTATGTTGCTATGTTTTTGTATAGTCAAACTTGAAGAAGTTTGACTTAGGACAAAACCAGAACACCTTCCATTTTGGACAGAGAGAGTATGAAATTATGAGTATC AAAATTCAGAAAATAATCTCTATGTTCTGTTACGTCCTATGTTCCAAAGTGTAAAGTCTTTTTAGGTTTATTGTCCTAAGTCAAAAGTTTTCAAGTTTGACCAAATTTATAGAAAATTATTTTCAACACTAAACAAATATACTATAGAGATATTCAGTGGTGGATTTAATGAAACTAATCTAATGTTGTTTATGTTGCTATGTTTTTGTATAGTCAAACTTGAAGAAGTTTGACTTAGGACAAAACCAGAACACCTTCCATTTTGGACAGAGAGAGTATGAAATTATGAGTATCTGAGCTGTTTACAATGTCCTTGATAATGAATGCCATGTTTCCTGATTTGATTTTGATCATCCATATTGATTTTTCTTGAGCTACTTATCTTATCTGTTTTATGTAGTTTACAGGGTGACTTTTTGGTTCATTTTATGGATATTGCTCGAGAGGAGCTTACAAAGAAACCAGAAGAAATATCTGCTGAAAAACTTCAGTCTCTGCTTGACATTGCTTTGCGGAGTACTGCAGCTGCTTCAGATCCAAGCCATGAGGAATTAATCTGCTGCGTGGAAAGAAGTTCCCTAATAAAAAACTGGCCCCTCTGAAAAACTTGGATGTGCTTACCCTGANATAGCTTGCTGCACAAATGTTGTCAGTCATGCAATAACCATACGGTTGG 2 2 3' arm Saccharum_officinarum mirnest 100 far-MIR437 0.0000009 -75.9 .(((....(((...(((.((((.(((.((((((((.((.((.((((..(((((..((((((((((((((..((((((((((((((......((((((((..((....(((((.(((((((.((((((((.((.....)).)))))(((((..........))))).))))))))))))))).))..))))))))..))))))))))))))..))))))))))))))))))))))).)).)).))))))))))).)).))))).))).....))).... (-75.9)