mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAACACTGTCTGGTAACGATGT ATCTTACTAGACAGTGCTGGA TGGTCCTCTATGGACATCTTACTAGACAGTGCTGGATTTATTTTATCTTTTCTAACACTGTCTGGTAACGATGTTTAAAGAGTGAGCCA 1 1 3' arm Xenopus_tropicalis mirbase mir-8 1e-21 gga-mir-200a 8e-26 -40.44 .((((((((.(((((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).)))))))).)))).)).)). (-40.44)